Merge pull request #3 from jjc2718/add_generalization

[ci skip]

This build is based on
fe81603.

This commit was created by the following CI build and job:
https://github.com/greenelab/jake_dissertation/commit/fe8160350801b436fbaeec03ab3b555eb9115a7a/checks
https://github.com/greenelab/jake_dissertation/actions/runs/6015562444

citations.tsv

@@ -99,3 +99,40 @@ manuscript_web	manuscript_web	manuscript_web	3yukLr06
 manuscript_zenodo	manuscript_zenodo	manuscript_zenodo	30nThzUa
 figshare_coefs	figshare_coefs	figshare_coefs	TIqbHsOH
 figshare_params	figshare_params	figshare_params	EZnvMHZD
+doi:10.1093/bioinformatics/btg062	doi:10.1093/bioinformatics/btg062	doi:10.1093/bioinformatics/btg062	pt72xvSB
+doi:10.1186/s13059-019-1861-6	doi:10.1186/s13059-019-1861-6	doi:10.1186/s13059-019-1861-6	1Gjm0AvRK
+doi:10.1016/j.ejca.2013.02.021	doi:10.1016/j.ejca.2013.02.021	doi:10.1016/j.ejca.2013.02.021	16Pv16qgL
+doi:10.1056/NEJMoa060096	doi:10.1056/NEJMoa060096	doi:10.1056/nejmoa060096	1RajAavD
+doi:10.1158/0008-5472.CAN-08-0436	doi:10.1158/0008-5472.CAN-08-0436	doi:10.1158/0008-5472.can-08-0436	dM8796ho
+doi:10.1056/NEJMoa1602253	doi:10.1056/NEJMoa1602253	doi:10.1056/nejmoa1602253	OEMQX6hJ
+doi:10.1586/erm.09.32	doi:10.1586/erm.09.32	doi:10.1586/erm.09.32	fdtdInsC
+doi:10.1056/NEJMe068292	doi:10.1056/NEJMe068292	doi:10.1056/nejme068292	1HDl7WHTm
+doi:10.1038/nrclinonc.2011.125	doi:10.1038/nrclinonc.2011.125	doi:10.1038/nrclinonc.2011.125	Yto9fv8i
+doi:10/bhfhgd	doi:10/bhfhgd	doi:10.1002/(sici)1097-0258(20000229)19:4<453::aid-sim350>3.0.co;2-5	kAXq3qou
+doi:10.4137/CIN.S408	doi:10.4137/CIN.S408	doi:10.4137/cin.s408	wnVDbuuP
+doi:10.1371/journal.pcbi.1004961	doi:10.1371/journal.pcbi.1004961	doi:10.1371/journal.pcbi.1004961	HmaoBsQm
+doi:10.1109/TAC.1974.1100705	doi:10.1109/TAC.1974.1100705	doi:10.1109/tac.1974.1100705	13HbWPwpj
+doi:10.1214/aos/1176344136	doi:10.1214/aos/1176344136	doi:10.1214/aos/1176344136	PUJO2E4L
+doi:10.1038/s43018-020-00169-2	doi:10.1038/s43018-020-00169-2	doi:10.1038/s43018-020-00169-2	ZJNDbtzm
+doi:10.1038/s42256-021-00408-w	doi:10.1038/s42256-021-00408-w	doi:10.1038/s42256-021-00408-w	QWTf9qrW
+doi:10.1073/pnas.2106682118	doi:10.1073/pnas.2106682118	doi:10.1073/pnas.2106682118	L3dpDrOG
+doi:10.1101/2023.06.26.546586	doi:10.1101/2023.06.26.546586	doi:10.1101/2023.06.26.546586	gOHkic9g
+doi:10.1371/journal.pcbi.1010984	doi:10.1371/journal.pcbi.1010984	doi:10.1371/journal.pcbi.1010984	b7RUXQvu
+https://dl.acm.org/doi/10.5555/3104322.3104425	https://dl.acm.org/doi/10.5555/3104322.3104425	url:https://dl.acm.org/doi/10.5555/3104322.3104425	Xk9rmxAA
+arxiv:1912.01703	arxiv:1912.01703	arxiv:1912.01703	iTP4h1rX
+doi:10.1146/annurev-pathol-011110-130206	doi:10.1146/annurev-pathol-011110-130206	doi:10.1146/annurev-pathol-011110-130206	qtYNZ2Q2
+doi:10.1002/cac2.12005	doi:10.1002/cac2.12005	doi:10.1002/cac2.12005	rzy1RWeA
+doi:10.1093/noajnl/vdaa088	doi:10.1093/noajnl/vdaa088	doi:10.1093/noajnl/vdaa088	HQx0QuE4
+doi:10.1038/s41525-022-00328-7	doi:10.1038/s41525-022-00328-7	doi:10.1038/s41525-022-00328-7	zbMcel6V
+doi:10.1093/bioinformatics/btx624	doi:10.1093/bioinformatics/btx624	doi:10.1093/bioinformatics/btx624	TIQTmEOG
+doi:10.1186/s13059-020-02100-5	doi:10.1186/s13059-020-02100-5	doi:10.1186/s13059-020-02100-5	YOm0bqVR
+doi:10.1016/j.patter.2022.100565	doi:10.1016/j.patter.2022.100565	doi:10.1016/j.patter.2022.100565	Mflfx7GP
+doi:10.1093/jnci/djt007	doi:10.1093/jnci/djt007	doi:10.1093/jnci/djt007	1HnyQJPcl
+doi:10.1158/0008-5472.CAN-13-2971	doi:10.1158/0008-5472.CAN-13-2971	doi:10.1158/0008-5472.can-13-2971	vYqd0FZY
+doi:10.1016/j.cell.2016.06.017	doi:10.1016/j.cell.2016.06.017	doi:10.1016/j.cell.2016.06.017	18vM3pLD6
+doi:10.1186/s13059-020-02177-y	doi:10.1186/s13059-020-02177-y	doi:10.1186/s13059-020-02177-y	Inb9g7Za
+doi:10.1038/s41576-021-00434-9	doi:10.1038/s41576-021-00434-9	doi:10.1038/s41576-021-00434-9	13prIHiSM
+arxiv:2306.15794	arxiv:2306.15794	arxiv:2306.15794	NMsylj71
+doi:10.1101/2023.04.30.538439	doi:10.1101/2023.04.30.538439	doi:10.1101/2023.04.30.538439	r5y0HbhJ
+doi:10.1101/2023.05.29.542705	doi:10.1101/2023.05.29.542705	doi:10.1101/2023.05.29.542705	Uetau8wh
+doi:10.1214/088342306000000060	doi:10.1214/088342306000000060	doi:10.1214/088342306000000060	cU8r76Rn