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R-skku-biohrs

R lecture: SKKU-biohrs

성균관대학교 바이오헬스규제과학과 강의

목표

R 은 단순한 통계프로그램이 아닌 데이터분석 전 과정을 포함하는 플랫폼이다. 본 강의는 data.table /magrittr 패키지 중심으로 빅데이터 매니지먼트를, 자체 패키지로 흔히 쓰는 통계를, rmarkdown/shiny 로 다양한 분석결과 정리법(문서, 슬라이드, 웹앱) 을 다룬다. 모든 예시는 심평원/보험공단/국민건강영양조사 데이터를 이용, 학생들은 바로 공공빅데이터 연구를 시작할 수 있다. 실습코드를 개인 github 저장소에서 관리, 오픈소스 생태계에 익숙해지면서 R 패키지까지 만들 수 있길 기대한다.

강사 이력

이름: 김진섭

소속: 연구지원법인 차라투 대표

학력: 성균관의대 졸업, 서울대학교 보건대학원 박사 수료.

주요 경력:

온라인 조교: 이건희

일정

일시: 매주 화요일 19-21시

회차 날짜 주제
1 8월 30일 강의계획안내, 깃허브(github), 공공의료빅데이터 소개
2 9월 6일 R 데이터 매니지먼트 base, code
3 9월 13일 R 데이터 매니지먼트 최근: tidyverse
4 9월 20일 R 데이터 매니지먼트: data.table, code, 슬라이드
5 9월 27일 R 데이터 매니지먼트: data.table 실전, code
6 10월 4일 R 데이터 시각화: 강의록, code, ggplot2 참고자료
7 10월 11일 기초통계이론: 확률(Probability) vs 가능도(Likelihood)(강의록, 슬라이드), 정규분포(강의록, 슬라이드)
8 10월 18일 중간고사
9 10월 25일 R 통계(1): 의학연구에서의 기술통계, code, tableone 소개, gtsummary 소개
10 11월 1일 R 통계(2): 회귀분석, 생존분석, 생존분석 추가자료, 리뷰어 위한 의학통계
11 11월 8일 R 통계(3): 비선형모형: GAM, 성향점수 매칭, 가중치, 국건영데이터 소개, code
12 11월 15일 R로 보고서쓰기: Rmarkdown, 엑셀, ppt로 저장하기
13 11월 22일 R로 웹앱 만들기: Shiny 소개
14 11월 29일 R 패키지 만들기
15 12월 6일 기말고사

특강

|1| 22.07.15 & 11.16| 데이터과학자가 갖춰야할 기술: 규제과학과 단기 교육 |

준비사항

개인 PC에서 실습을 원한다면 http://www.r-project.orghttps://rstudio.com/products/rstudio/download/#download 에서 RRStudio 를 설치하자.

클라우드 환경인 RStudio cloud 에서도 가능하며, 회원가입 후 아래를 따라 강의자료가 포함된 실습환경을 생성하자.

  1. https://rstudio.cloud 회원 가입
  1. 위쪽 "Projects" 클릭 후, "New Project" 를 눌러 "New Project from Git Repo" 를 선택 후, Repo 주소 https://github.com/jinseob2kim/R-skku-biohrs 입력.

아래 패키지들을 미리 설치하면 좋다.

install.packages(c("data.table", "magrittr", "fst", "ggplot2", "ggpubr", "officer", "rvg", "tableone", "gtsummary", "MatchIt", "twang", "usethis", "gitcreds"))

참고자료

실습데이터 및 설명자료 다운로드

심평원 약품성분명코드

강의영상

https://www.youtube.com/playlist?list=PLe9JpZdWdsL3pKvV31D2xmnboBymGUVDz