diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04 index 0318f1b..7d171e2 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04 @@ -9,7 +9,7 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep \ No newline at end of file + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big index baf2b7e..81cbbd7 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big @@ -9,13 +9,13 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png + libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx && sudo apt-get -y clean +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png RUN pip3 install vtk ENV RETICULATE_PYTHON="/usr/bin/python3" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-11.7 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-11.7 index 678ed23..2f57377 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-11.7 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-11.7 @@ -9,17 +9,17 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo cuda 11.7 + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo cuda 11.7 ENV CUDA_PATH="/usr/local/cuda-11.7" ENV PATH="${CUDA_PATH}/bin:${PATH}" ENV LD_LIBRARY_PATH="${CUDA_PATH}/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}" RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png + libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx && sudo apt-get -y clean +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png RUN pip3 install vtk ENV RETICULATE_PYTHON="/usr/bin/python3" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-12.0 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-12.0 index 38b5516..e3d2742 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-12.0 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-cuda-12.0 @@ -9,17 +9,17 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo cuda 12.0 + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo cuda 12.0 ENV CUDA_PATH="/usr/local/cuda-12.0" ENV PATH="${CUDA_PATH}/bin:${PATH}" ENV LD_LIBRARY_PATH="${CUDA_PATH}/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}" RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png + libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx && sudo apt-get -y clean +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png RUN pip3 install vtk ENV RETICULATE_PYTHON="/usr/bin/python3" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.4.1 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.4.1 index 22bb0c3..29d061d 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.4.1 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.4.1 @@ -9,14 +9,14 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo hip 5.4.1 + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo hip 5.4.1 RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png + libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx && sudo apt-get -y clean +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png RUN pip3 install vtk ENV RETICULATE_PYTHON="/usr/bin/python3" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.6.1 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.6.1 index 072bbaa..cc922b7 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.6.1 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-big-hip-5.6.1 @@ -9,14 +9,14 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo hip 5.6.1 + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo hip 5.6.1 RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png + libxml2 libxml2-dev libgl1-mesa-glx && sudo apt-get -y clean +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rinside reticulate --rpackage languageserver --rpackage png RUN pip3 install vtk ENV RETICULATE_PYTHON="/usr/bin/python3" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-11.7 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-11.7 index 1e0353b..3178535 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-11.7 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-11.7 @@ -9,11 +9,11 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo cuda 11.7 + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo cuda 11.7 ENV CUDA_PATH="/usr/local/cuda-11.7" ENV PATH="${CUDA_PATH}/bin:${PATH}" ENV LD_LIBRARY_PATH="${CUDA_PATH}/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-12.0 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-12.0 index 090e24f..d2cc3b2 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-12.0 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-cuda-12.0 @@ -9,11 +9,11 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo cuda 12.0 + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo cuda 12.0 ENV CUDA_PATH="/usr/local/cuda-12.0" ENV PATH="${CUDA_PATH}/bin:${PATH}" ENV LD_LIBRARY_PATH="${CUDA_PATH}/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}" \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.4.1 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.4.1 index e01144d..20962df 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.4.1 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.4.1 @@ -9,8 +9,8 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo hip 5.4.1 \ No newline at end of file + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo hip 5.4.1 \ No newline at end of file diff --git a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.6.1 b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.6.1 index 75d92ea..0d60f93 100644 --- a/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.6.1 +++ b/gen/Dockerfile.ubuntu-22.04-hip-5.6.1 @@ -9,8 +9,8 @@ WORKDIR /home/vscode RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - openssh-server python3-pip -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo r -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo openmpi -RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small rdep -RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --sudo hip 5.6.1 \ No newline at end of file + openssh-server python3-pip && sudo apt-get -y clean +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo r +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo openmpi +RUN /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean rdep +RUN sudo /tmp/install.sh --group --retry 3 --retry-delay 5 --small --clean --sudo hip 5.6.1 \ No newline at end of file diff --git a/generate.Rt b/generate.Rt index 18e0518..74c8204 100644 --- a/generate.Rt +++ b/generate.Rt @@ -24,10 +24,10 @@ packs = paste(packs, collapse=" "); ?> RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive && sudo apt-get update && \ sudo apt-get -y install --no-install-recommends \ - && sudo apt-get -y clean